Мир больше, чем ты думаешь... Оставшиеся в живых люди вынуждены жить под куполами городов, разбросанных по негостеприимной и засушливой планете. Они живут в полностью контролируемом обществе и обслуживаются авторейвами (англ. AutoLive — «автоматическая жизнь») — андроидами, запрограммированными на служение людям. В городе Ромдо инспектор Рил Мэйер , внучка правящего регента, расследует дело об авторейве, который сошёл с ума после заражения загадочным вирусом «Когито». При выяснении обстоятельств дела она сталкивается с существом, которое называют Прокси . В то же время иммигрант из города-купола Моск по имени Винсент Лоу скрывается от закона, обвинённый в участии в преступлениях, связанных вирусом «Когито».

Действие происходит в Германии, в Дюссельдорфе. Неизвестный проникает в дом семьи Либертов, убивает родителей и простреливает их сыну голову, не трогает лишь его сестру, которая забывает всё от шока. В том же городе работает гениальный японский нейрохирург Кэндзо Тэмма, сумевший спасти жизнь мальчика. Спустя много лет раненого человека привозят в госпиталь. Спасши ему жизнь, Кэндзо узнаёт, что тот причастен к продолжающимся в Германии серийным убийствам. Вскоре и Кэндзо оказывается замешан в этом деле, когда у него на глазах тот самый спасённый ребёнок, выросший теперь в юношу, хладнокровно убивает спасённого человека. Кэндзо предстоит очистить своё имя, узнать о спасённом им много лет назад ребёнке и переосмыслить саму ценность жизней, которые он спасает, работая хирургом.

Мима Киригоэ, участница поп-группы «CHAM!», решает бросить карьеру певицы, чтобы попробовать себя в качестве актрисы. Некоторые её фанаты недовольны этим решением — в особенности невменяемый и начавший преследовать девушку парень, который называет себя Мэмания. По мере продвижения Мимы в новой карьере близкие ей люди погибают от рук жестокого убийцы, и вскоре Мима постепенно теряет способность отличать реальность от вымысла...

В Токио объявляется неуловимый преступник. Это Сёнэн Батто («мальчик с битой»), подросток на роликах, вооружённый золотистой бейсбольной битой. Первой его жертвой становится молодая девочка-дизайнер Цукико Саги . Цукико кладут в больницу, полиция начинает вялые поиски хулигана, а нападения тем временем совершаются снова и снова. Успешный школьник, две девушки с одной парой глаз, группа самоубийц, игрок, художник... Жертвы множатся, интерес возрастает, и вскоре о Мальчике уже слагают легенды на скамейках возле подъезда. И в тот самый миг, когда кто-то говорит о Мальчике , где-то в темноте загорается золотая дуга опускающейся биты.

В недалёком будущем был открыт революционно новый метод психотерапии. С помощью прибора, называющегося «DC Mini», можно проникать в сны людей и изучать их бессознательные мысли. Но перед тем, как правительство собиралось принять закон, дающий право использовать такие продвинутые психиатрические технологии, один из прототипов был украден, из-за чего в научно-исследовательском центре поднялся шум. В неправильных руках это устройство может стать оружием, позволяя владельцу полностью уничтожить личность сновидца непосредственно во время сна. В попытке выяснить, кто стоит за заговором, знаменитая учёная Ацуко Тиба входит в мир сновидений под своим экзотическим альтер-эго по имени Паприка .

К 2029 году границы реального мира практически размываются развитием интернета и кибернетики, но из-за этого человек становится уязвимым к хакерским атакам. Разыскиваемый хакер, известный как «Кукловод», начинает использовать эту уязвимость в политических целях. Девятому отделу, группе кибернитически усовершенствованных полицейских, поручено найти и остановить Кукловода. Однако по мере расследования начинают возникать сомнения, что же является верным: то, что делают люди, или то, что делает Кукловод... Особенно в этом мире, где различие между человеком и машиной практически стёрлось.

Второкурсник Токийского университета обнаруживает, что жизнь его безнадёжно испорчена. Клуб, куда он вступил, безнадежён, лучший друг оказывается негодяем и подлецом, а других друзей у него нет. Вдобавок, единственную девушку, с которой он хотел сблизиться, увёл его так называемый друг. Впрочем, как известно, большинство богов живут в Киото, и наш герой получает второй шанс, столкнувшись поздно ночью в рамэнной с кем-то, называющим себя богом.

Лэйн Ивакура кажется совсем обычной девочкой, которая толком не имеет даже опыта работы на компьютере, да и с людьми не особо сходится. Но после внезапного самоубийства одной из школьниц, странных слухов об этом и попыток одноклассниц вытащить её куда-нибудь, она постепенно понимает, что всё в этом мире на самом деле совсем не такое, каким представляется... Даже она сама...

Пять лет назад волна мистических убийств потрясла город, и теперь, кажется, всё повторяется вновь. Чудовища, призраки, странные создания, которым нет названия на языке людей, наполняют город, и никто не может быть в безопасности, даже при свете солнца. Людские пороки и тёмные стороны прорываются наружу в эти тёмные времена. Борьбу с ними начинает таинственное существо по имени Бугипоп. Но что за тайна таится в его прошлом? Как он связан с событиями пятилетней давности? Многих интересуют эти вопросы, но им дано найти лишь часть ответов. Что-то скрывается в тени. Вы точно уверены в своей безопасности?